S obzirom da se bratstvo manastira istaklo u Kočinoj krajini pomažući namirnicama vojsku Koče Aranđelovića 1788. godine, Turci su zapalili manastir, a monasi su, kako bi se zaštitili, pobegli. Kada je manastir zapaljen, u njemu je otkrivena i riznica u zidu iza ikona u kojoj je kneginja Milica skrila blago, između ostalog i krunu kneza Lazara. Manastir Ljubostinja je nakon toga obnovljen tek u 19. veku.

Moravska arhitektura dovela je do toga da manastir svojim izgledom oduševljava čak i one koji se ne razumeju naročito u arhitekturu. Što se tiče fresaka, levo od ulaza nalazi se freska na kojoj je prikazana kneginja Milica, zatim knez Lazar, a sa desne strane je freska despota Stefana i njegovog brata Vuka.

Najznačajniji dar koji je manastir Ljubostinja ikada dobio jeste pokrov sa pohvalom knezu Lazaru koji je na svili izvezla u zlatu Jefimija, Uglješina žena. Ona je takođe sahranjena u Ljubostinji i grob joj se nalazi sa desne strane ulaza u crkvu.